微生物学名词审定委员会于1985年12月正式成立，王大耜先生任第一届主任委员。从1985年至1988年三年期间，完成了第一批1525条名词的审定工作，1988年正式公布。第二届微生物学名词审定委员会于2006年正式成立，程光胜先生任主任委员，在第一版的基础上进行了修订增补，并增加了定义或注释。2012年完成了第二版审定工作，共审定公布名词2407条。